Struktura mikrobnih zajednica (sastav, brojnost, biomasa, proizvodnja i aktivnost), veza između aktivnosti i filogenetske raznolikosti bakterioplanktona
Primjena lipida kao indikatora promjena vezanih uz izvore u sedimentu i sedimentirajućim česticama, prijenosu organske tvari kroz hranidbene lance, te odnos fitoplankton-bakterije u sluzavim makroagregatima i duž gradijenata u vodenom stupcu.
Mikrobiologija okoliša; specifične ekološke studije o opstanku patogenih mikroorganizama u moru, procjena sanitarne kvalitete vode, prijenos organske tvari unutar mikrobne petlje i biodegradacija organskih spojeva i okolišu mora, uloga bakterija u nastajanju polisaharidnih i proteinskih čestica i sluzavih makroagregata.
Kruženje hranjivih soli i enzimatski procesi i pelagičkim ekosustavima
Primijenjene studije: procjena kvalitete uzgojenih ribljih populacija, ekološke studije utjecaja područja uzgoja riba i školjkaša na okoliš, ekološke studije neuobičajenih pojava koje ugrožavaju ljudsko zdravlje, turizam i ribarstvo, fiziologije i ekologije invazivnih makroalgi Caulerpa taxifolia i Caulerpa racemosa.
